牛奶所含的大量动物性蛋白质，会导致钙质的流失。动物性蛋白质摄入量最高的女性，髋部骨折率也最高。以爱斯基摩人为例，他们的动物性蛋白质摄入量很高，但骨骼却非常脆弱。摄入体内的大多数蛋白质被分解成为氨基酸。蛋白质和氨基酸都是酸性的，因此身体必须透过溶解骨骼来提供钙质和磷酸盐，以中和这些过量的酸性物质，防止可能对身体造成的伤害。当磷酸盐中和氨基酸的同时，—同释放出来的钙离子会经由肾脏排泄到尿液中。而动物性蛋白质含有高量的含硫氨基酸，如蛋氨酸和胱氨酸，这些氨基酸会促进肾脏排泄钙质。因此，动物性蛋白质比植物性蛋白质更容易引起钙质流失。